Nacionalinio muziejaus Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės valdovų rūmų padalinys Mokslinių tyrimų centras organizuoja, sistemina ir vykdo kultūros, meno, istorijos, archeologijos bei kitus mokslinius tyrimus, kartu su mokslo ir studijų institucijomis bei mokslinių tyrimų įstaigomis rengia nacionalines ir tarptautines konferencijas, seminarus, įgyvendina kitus kultūros paveldo tyrimo ir aktualinimo projektus, susijusius su Lietuvos valdovų rūmais, rengia nuolatines ir laikinas ekspozicijas, organizuoja parodas bei kitus kultūros ir švietimo renginius, publikuoja tyrimų rezultatus.